10 邓禹从汾阴渡过黄河，进入夏阳县。更始帝左辅都尉公乘歙带领他的部队十万人与左冯翊所部兵马在卫县布防，抵御邓禹。邓禹将他们击破，公乘歙败走。
宗室刘茂在京县、密县之间聚众起兵，自称厌新将军，攻下颍川、汝南，部众达到十余万人。刘秀派骠骑大将军景丹、建威大将军耿弇、强弩将军陈俊攻打他。刘茂前来投降，被封为中山王。
11 七月二十九日，刘秀抵达怀县，派耿弇、陈俊驻扎在五社津黄河渡口，监视荥阳以东；派吴汉率建义大将军朱祜等十一位将军，将朱鲔包围在洛阳。八月，刘秀进入河阳县。
12 更始政权宰相李松从掫城带兵回来，跟从更始帝，与赵萌一起，攻打王匡、张卬于长安。连战一个多月，王匡等败走，更始帝迁居长信宫。
赤眉军到了高陵，王匡、张卬等人迎降，于是连兵一处，一起攻打东都门。李松出战，被赤眉军生擒。李松的弟弟李况为城门校尉，开门把赤眉军放进来。九月，赤眉军进入长安，更始帝单骑而走，从厨城门出逃。
当初，式侯刘恭因为赤眉军立了他的弟弟刘盆子，把自己绑了，到诏狱报到。更始帝败走，刘恭才走出诏狱，求见定陶王刘祉。刘祉将他的刑具解下，两人一起追随更始帝到渭水河畔。右辅都尉严本，担心更始帝走失，自己会被赤眉诛杀，于是将更始帝迁往高陵，自己率兵宿卫，实际上是将更始帝软禁起来。更始帝的将相都投降了赤眉。只有丞相曹竟拒绝投降，用佩剑格斗，被杀。