造反派冲击二机部的专家，很快被周恩来知道了。周恩来为此气愤地拍了桌子，要求中央军委严肃处理，国防科委、二机部要认真做好善后工作，对一些专家该道歉的道歉，该赔偿的赔偿，并将处理结果报告中央军委。他还严厉要求，以后，一些从事机密工作的专家，名字不许上大字报。
周恩来发火之后，核科学家们的处境，相对好了一些。
聂荣臻也在想尽一切办法保护与“两弹一星”有关的科学家们。北京卫戍区司令员傅崇碧是他在晋察冀的老部下，“文革”期间，卫戍区司令这个位置十分重要。1966年下半年、1967年上半年，聂荣臻两次找到傅崇碧，给了他一个名单，叫他派兵保护名单上的科学家，还特别叮嘱，一定要保管好涉及到国防尖端的机密材料。
一天，中央文革小组的人命令造反派去揪斗七机部的专家。聂荣臻得到消息，马上给傅崇碧打电话，下令“无论如何要保护这些人”。于是，任新民、梁守槃等科学家们，被请到七机部的一座僻静的楼上。傅崇碧先是派一个连在楼下警戒，感到还是有些不放心，又派了一个加强连在此保护，对其他一些科研机构也加强了警戒。结果，造反派的计划落空了。
江青很快知道了这事，她责问傅崇碧：“谁叫你保护这些‘臭老九’的？”
